ГРАФОВАЯ НОВАЯ МОДЕЛЬ СЛИЯНИЯ ДАННЫХ МОЗГА И ГЕНОВ ДЛЯ КЛАССИФИКАЦИИ ДЕПРЕССИИ

Неда Фироз, Александр Н. Савостьянов

Аннотация


Депрессия является сложным нейропсихиатрическим расстройством, возникающим в результате взаимодействий на молекулярном и нейрональном уровнях, однако большинство вычислительных подходов анализируют нейрофизиологические и генетические данные по отдельности. В данном исследовании предлагается основанная на графовых нейронных сетях (GNN) структура для интеграции признаков электроэнцефалографии (ЭЭГ) и генетических маркеров с целью поддержки автоматизированной классификации депрессии. Используя мультимодальный поднабор набора данных ICBrainDB, мы проанализировали 383 участника (349 человек в контрольной группе и 34 человека с депрессией), для которых были доступны как данные ЭЭГ, так и генетические данные. Признаки ЭЭГ, полученные из различных областей скальпа и состояний покоя, а также переменные на уровне генов из специально подобранной панели были представлены в качестве узлов в едином графе, где ребра определялись корреляционной структурой, вычисленной только на обучающей выборке. Архитектура передачи сообщений в стиле GCN с глобальным объединением была обучена с использованием конвейера предварительной обработки, контролирующего утечку данных, и оценена в условиях дисбаланса классов с применением всесторонних метрик дискриминации, согласия и калибровки. На отложенном тестовом наборе модель достигла ROC-AUC = 0,9265 и точности (accuracy) = 0,9221, с высокой специфичностью (0,9857) и хорошо откалиброванными вероятностными выходами. Оптимизация порога классификации улучшила обнаружение класса меньшинства, обеспечив лучший показатель F1 = 0,5455 и сбалансированную точность 0,7071. Эти результаты демонстрируют, что учитывающее сетевую структуру объединение сигналов ЭЭГ и генов с помощью GNN может эффективно улавливать кроссмодальные зависимости, значимые для депрессии, и обеспечивать масштабируемую и интерпретируемую основу для приложений точной психиатрии.

Ключевые слова


обнаружение депрессии, электроэнцефалография (ЭЭГ), генетические маркеры, мультимодальное обучение, графовые нейронные сети (GNN), сетевое моделирование, машинное обучение, прогнозирование психического здоровья

Полный текст:

PDF (English)

Литература


1. A. Steiger and M. Kimura. Wake and sleep EEG provide biomarkers in depression. J Psychiatr Res, v. 44, no. 4, pp. 242-252, Mar. 2010. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jpsychires.2009.08.013.

2. Z. Xue and R. Marculescu. Dynamic Multimodal Fusion. Mar. 2022. DOI: https://doi.org/10.48550/arXiv.2204.00102.

3. Q. Yu, R. Wang, J. Liu, L. Hu, M. Chen, and Z. Liu. GNN-Based Depression Recognition Using Spatio-Temporal Information: A fNIRS Study. IEEE J Biomed Health Inform, v. 26, no. 10, pp. 4925-4935, Oct. 2022. DOI: https://doi.org/10.1109/JBHI.2022.3195066. EDN: FBTUNA.

4. Y. Shen, M. Xu, and X. Fan. A Novel EEG-Based Depression Detection Framework. 2022, pp. 645-654. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-031-06767-9_53.

5. M. Shadrina, E.A. Bondarenko, and P.A. Slominsky. Genetics Factors in Major Depression Disease. Front Psychiatry, v. 9, Jul. 2018. DOI: https://doi.org/10.3389/fpsyt.2018.00334. EDN: YCAYXJ.

6. K.A. Zorina, F.A.A. Ibrahim, N.G. Mishchenko, A.A. Zozulya, A.E. Saprygin, and A.N. Savostyanov. Development of the EEG and Genetic Module for the ICBrainDB Experimental Database to Search for Depressive Disorder Markers. 2024 IEEE 25th International Conference of Young Professionals in Electron Devices and Materials (EDM), IEEE, Jun. 2024, pp. 2180-2183. DOI: https://doi.org/10.1109/EDM61683.2024.10615163.

7. N. Firoz, O.G. Berestneva, A. Savostyanov, and S.V. Aksyonov. Multi-Modal Fusion of EEG and Genetic Markers for Depression Prediction from ICBrainDB. 2025 IEEE XVII International Scientific and Technical Conference on Actual Problems of Electronic Instrument Engineering (APEIE), IEEE, Nov. 2025, pp. 1-9. DOI: https://doi.org/10.1109/APEIE66761.2025.11289224.

8. S.M. Atoar Rahman et al. Advancement in Graph Neural Networks for EEG Signal Analysis and Application: A Review. IEEE Access, v. 13, pp. 50167-50187, 2025. DOI: https://doi.org/10.1109/ACCESS.2025.3549120. EDN: UFHEXG.

9. T. Zhang, T. Hu, M. Wu, Z. Xu, and C. L. Philip Chen. ACM-GNN: Adaptive Cluster-Oriented Modularity Graph Neural Network for EEG Depression Detection. IEEE Trans Comput Soc Syst, pp. 1-13, 2025. DOI: https://doi.org/10.1109/TCSS.2025.3576373.

10. D. Chicco and G. Jurman. The advantages of the Matthews correlation coefficient (MCC) over F1 score and accuracy in binary classification evaluation. BMC Genomics, v. 21, no. 1, p. 6, Dec. 2020. DOI: https://doi.org/10.1186/s12864-019-6413-7. EDN: OVTHSE.

11. A.M. Qadri, A. Raza, K. Munir, and M.S. Almutairi. Effective Feature Engineering Technique for Heart Disease Prediction With Machine Learning. IEEE Access, v. 11, pp. 56214-56224, 2023. DOI: https://doi.org/10.1109/ACCESS.2023.3281484. EDN: OOEIYK.

12. Q.H. Nguyen et al. Influence of Data Splitting on Performance of Machine Learning Models in Prediction of Shear Strength of Soil. Math Probl Eng, v. 2021, pp. 1-15, Feb. 2021. DOI: https://doi.org/10.1155/2021/4832864. EDN: OAKYEE.

13. A.C. Acock. Working With Missing Values. Journal of Marriage and Family, v. 67, no. 4, pp. 1012-1028, Nov. 2005. DOI: https://doi.org/10.1111/j.1741-3737.2005.00191.x.

14. M. Mohammadi et al. Data mining EEG signals in depression for their diagnostic value. BMC Med Inform Decis Mak, v. 15, no. 1, p. 108, Dec. 2015. DOI: https://doi.org/10.1186/s12911-015-0227-6. EDN: YDSFKZ.

15. G. Palumbo, D. Carneiro, and V. Alves. Objective metrics for ethical AI: a systematic literature review. Int J Data Sci Anal, v. 20, no. 2, pp. 247-267, Aug. 2025. DOI: https://doi.org/10.1007/s41060-024-00541-w. EDN: TSBLBZ.

16. D.A. Redelmeier, D.A. Bloch, and D.H. Hickam. Assessing predictive accuracy: How to compare brier scores. J Clin Epidemiol, v. 44, no. 11, pp. 1141-1146, Jan. 1991. DOI: https://doi.org/10.1016/0895-4356(91)90146-Z.

17. V. Pillai, D. A. Kalmbach, and J. A. Ciesla. A Meta-Analysis of Electroencephalographic Sleep in Depression: Evidence for Genetic Biomarkers. Biol Psychiatry, v. 70, no. 10, pp. 912-919, Nov. 2011. DOI: https://doi.org/10.1016/j.biopsych.2011.07.016.

18. T. Chen, R. Hong, Y. Guo, S. Hao, and B. Hu. MS2-GNN: Exploring GNN-Based Multimodal Fusion Network for Depression Detection. IEEE Trans Cybern, v. 53, no. 12, pp. 7749-7759, Dec. 2023. DOI: https://doi.org/10.1109/TCYB.2022.3197127. EDN: XLBEDS.

19. G. Luo et al. Exploring Adaptive Graph Topologies and Temporal Graph Networks for EEG-Based Depression Detection. IEEE Transactions on Neural Systems and Rehabilitation Engineering, v. 31, pp. 3947-3957, 2023. DOI: https://doi.org/10.1109/TNSRE.2023.3320693. EDN: COXLKW.

20. M. Abbasian et al. Foundation metrics for evaluating effectiveness of healthcare conversations powered by generative AI. NPJ Digit Med, v. 7, no. 1, p. 82, Mar. 2024. DOI: https://doi.org/10.1038/s41746-024-01074-z. EDN: YKVQIC.




DOI: http://dx.doi.org/10.26583/bit.2026.2.07

Ссылки

  • На текущий момент ссылки отсутствуют.


Лицензия Creative Commons
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.